Dal 2016, AMAT fornisce supporto al Comune di Milano per il monitoraggio dei servizi resi dal Gestore AMSA e previsti dal contratto di igiene ambientale, tramite diverse tipologie di verifiche:
A queste verifiche, si aggiungono specifici sopralluoghi effettuati in seguito alle segnalazioni dei cittadini o in relazione ad attività di rimozione di rifiuti speciali, pericolosi e non.
Oltre alle attività di monitoraggio dei servizi di igiene ambientale, AMAT ha collaborato alla stesura del contratto di servizio in vigore dal 2017, stipulato tra AMSA e il Comune di Milano, occupandosi degli aspetti tecnici legati alla ridefinizione del sistema di monitoraggio (misurazione delle prestazioni, qualità del servizio e trasmissione dati), alla revisione delle schede tecniche dei servizi oggetto di affidamento e allo sviluppo, incluso il successivo monitoraggio, del Piano Strategico per il Miglioramento del Servizio (Riduzione delle Emissioni Atmosferiche e Incremento della Raccolta Differenziata). AMAT è coinvolta attivamente in queste attività, in quanto sta fornendo supporto per la successiva gara per l’affidamento del servizio di raccolta rifiuti ed igiene urbana a Milano. Svolge anche attività di verifica e analisi dei dati relativi al monitoraggio dei servizi definendo il perimetro dei servizi, le modalità di monitoraggio e l’applicazione di nuovi indicatori di prestazione qualitativi e quantitativi.
Sempre in tema di igiene ambientale, a partire dal 2017, è stata realizzata da AMAT una campagna finalizzata all'individuazione della presenza di piante di Ambrosia Artemisiifolia, su aree e pertinenze stradali di proprietà del Comune di Milano, necessaria per le operazioni di diserbo e sfalcio da parte del Gestore.